朱砂中含有硫化汞，其经消化道吸收后可破坏血红蛋白形成可溶性化合物，导致血液中的铁元素减少，引起缺铁性贫血的发生。
朱砂中的硫化汞被胃酸分解为二价汞离子，二价汞离子与蛋白质结合成硫化汞复合物，这种复合物能够抑制血红素合成酶的活性，从而影响血红素的合成，使铁元素缺乏，引发缺铁性贫血。
如果患者长期大量摄入朱砂，则可能会出现慢性中毒的现象，表现为失眠、多梦、心悸、注意力不集中等症状。
朱砂作为中药材时需谨慎使用，并且不宜过量服用，以免引起不良反应。在存放过程中要避免接触高温或强光直射，以防止氧化变质。
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